转录组即特定组织或细胞在某一功能状态下所有转录本的总和，包括 mRNA 和非编码 RNA（即Non-coding RNA，如 tRNA，rRNAs，microRNAs，piRNAs 和 long ncRNAs 等）。转录组测序 (Transcriptome sequencing) 主要指通过高通量测序研究特定组织或细胞在某个时期转录出来的 mRNA，可以用来研究基因结构和基因定量分析，并预测新转录本，是深入研究转录组复杂性的强大手段和工具。目前，转录组测序已经被广泛应用于动植物发育阶段的研究、优良品种基因的筛选和疾病治疗等。